Учебные дисциплины

Большой практикум

Ременников С.М.

Всего учебных часов 390, из них аудиторных 390

Зачёты по сессиям: 7,8

ПЕРЕЧЕНЬ ЦИКЛОВ БОЛЬШОГО ПРАКТИКУМА ДЛЯ СТУДЕНТОВ КАФЕДРЫ БИОФИЗИКИ (4 курс, 7 и 8 семестры)

Циклы по выбору студента и его научного руководителя

1. Электронно-конформационное взаимодействие и динамика биополимеров (3 задачи):

• метод ЯМР
• мессбауэровская спектроскопия
• молекулярно-динамический вычислительный эксперимент с элементами компьютерной графики

2. Спектральные и спектрально-кинетические методы  исследования фотосинтетических систем  (7 задач):

• объекты от целостных  (листья, водоросли, бактерии) до ПБК, РЦ, сухих пленок
• абсорбционная  производная и разностная спектроскопия
• спектры линейного дихроизма
• спектры флуоресценции
• фотоиндуцированные сигналы ЭПР
• спектральный анализ в широком диапазоне температур (от комнатной до 77  К)

3. Изучение свойств исскуственных и биологических мембран (6 задач):

• электрические свойства мембран
• ионные токи и профиль рН в возбудимых мембранах
• метод пэтч-клямп
• фотоиндуцированный  транспорт ионов в хлоропластах. 

4. Исследование роли ионов Са²⁺ в регуляции процессов формирования и проведения ритмического возбуждения (5 задач):

• внеклеточная и внутриклеточная регистрация мембранных потенциалов в животных клетках
• спектроскопия комбинационного рассеяния
• компьютерное моделирование процессов спонтанного и вызванного ритмического возбуждения

5. Микрофотометрические методы анализа клеток и их использование в экологии (3 задачи):

• метод флуоресцентных зондов,
• фотоингибирование и фотодеструкция,
• исследование переменной флуоресценции; объекты - отдельные клетки, клеточные популяции растительного и животного происхождения, листовые пластины и др. 

6. Методы фотобиологии микроорганизмов ( 3 задачи):

• чувствительность дрожжей к различным диапазонам оптического излучения (УФ и видимый свет )
• анализ процессов инактивации клеток
• образование летальных фотопродуктов и способы репарации при воздействии светом                    

7. Методы математического моделирования  ( 3 задачи ):

• модели первичных процессов с временами порядка мсек в ФС1, комплексе b⁶ f и ФС2
• модели вторичных процессов ( цикл Кальвина )
• объединение блоков моделей, использование полной модели

8. Оценка состояния фотосинтетического аппарата интактного растения с помощью параметров флуоресценции хлорофилла (1 задача):

• использование автоматизированного комплекса Шрайбера.

9. Исследование математических моделей нелинейных распределенных систем (3 задачи):

• изучение явлений самоорганизации в распределенных биологических системах
• ознакомление с методами исследования систем "реакция-диффузия и реакция-электродиффузия"

10. Фотоиндуцированная генерация газов (О₂ и Н₂ ) и их транспорт в модельных и биологических мембранах (3 задачи):

• изучение проницаемости мономолекулярных липидных пленок для кислорода
• исследование транспорта электронов в фотосинтетических мембранах посредством полярографии

11. Пикосекундная лазерная флуорометрия фотосинтезирукющих объектов (1 задача):

• лазерные генераторы света, электронно-оптические методы анализа с высоким временным разрешением

12. Молекулярное моделирование: моделирование на основании гомологии  пространственной структуры слабого нейротоксина ТХW6 – на базе ИБХ РАН.

13. Биотехнология: стерильная  ферментация генно-инженерных штаммов бактерий – на базе ГосНИИ генетики.

14. Изучение микровязкости липидных мембран под действием различных факторов с использованием метода ЭПР и спиновых зондов.

15. Специализированные методы микроскопии – на базе ИБХ РАН.

Циклы, обязательные для выполнения всеми студентами:

1.    Методы изотопного анализа (3 задачи ) - на базе кафедры физико-химической биологии биофака МГУ.

2.    Медицинская биофизика (3 задачи) - на базе института биологии гена РАН и кафедры биофизики Биологического факультета МГУ:

• микрохирургия клетки, микроинъекции;
• количественная видеомикроскопия;
• культивирование клеток млекопитающих.

3.      Молекулярная биология (4 задачи) - на базе института биоорганической химии РАН:

• выделение плазмидной ДНК из бактерий;
• выделение суммарной ДНК из дрожжей;
• методы генной инженерии ( Н-фосфонатный метод и др.)

4.      Генная инженерия (5 задач ) - на базе института биологии гена РАН:

• метод ПЦР и электрофорез ДНК в агарозе;
• получение компетентных клеток, трансфоормация;
• выделение плазмид, редукция рекомбинантного белка;
• рестрикционный анализ; получение экспрессивного белка и его характеристика посредством электрофореза в ПААГ. 

5.      Гибридомная технология – на базе НИИ трансплантологии и искусственных органов Минздрава РФ:

• основные этапы получения моноклональных антител.

6.      Выделение и определение активности моноклональных антител МNA4 к растительному токсину вискумину (ML-1) – на базе НИИ трансплантологии и искусственных органов Минздрава РФ.

7. Сайт-специфический мутагенез: введение направленной мутации в ген белка – на базе ИБХ РАН.